Simula��o do Supercomputer do v�rus
Um dos supercomputers os mais poderosos do mundo simulou um momento na vida de um v�rus real. A simula��o � a primeira para capturar um organismo biol�gico inteiro em tal detalhe molecular intricado.

A biologia computacional alcangou finalmente o n�vel de sofistica��o e a utilidade do jogo video Pong dos anos 70.

Mas soa como n�s deve alcangar al�m dos invasores do espa�o e dos n�veis do homem de Pac em 5 anos. Talvez n�s teremos realmente o equivalente do bioinfo de Excel at� l�.

Funcionando em uma m�quina no centro nacional para aplica��es da supercomputa��o, Urbana, o programa calculou como cada um do milh�o ou assim os �tomos no v�rus e em uma gota circunvizinha da �gua de sal estavam interagindo com quase cada outro �tomo cada femtosegundo, ou millionth de um bilion�simo de um segundo.

A equipe controlou modelar o v�rus inteiro na a��o para 50 billionths de um segundo. Tal tarefa tomaria a um computador de secret�ria ao redor 35 anos, diz Schulten. Este � apenas um primeiro relance, diz. Mas olha lindo.

O modelo mostra que o revestimento do v�rus desmorona sem seu material gen�tico. Isto sugere que, ao reproduzir, o v�rus construa seu revestimento em torno do material gen�tico um pouco do que introduzindo o material gen�tico em um revestimento completo. N�s vimos algo que � verdadeiramente que revolucion�rio, Schulten diz.

Finalmente, os bi�logos computacionais gostariam de simular v�rus maiores tais como a gripe ou os sistemas biol�gicos complexos em uma pilha - e por uns per�odos mais longos, tais como o mil�simo de um segundo de que pudesse tomar para observar prote�nas em um interruptor da pilha um gene fora. Estes modelos de computador devem permitir que os investigadores descubram detalhes sobre tais processos que podem faltar observando um v�rus real.

Mas tais simula��es n�o se tornar�o poss�veis at� que a gera��o seguinte de supercomputers esteja constru�da nos pr�ximos cinco anos, Schulten dizem.

Fonte: Natureza