Micro Guide To Distributed Batch Processing With PBS (Portable Batch System) Micro Guide de traitement par lots distribués avec du PBS (Portable Batch System)
PBS is an old name in distributed batch processing circles. PBS est un ancien nom dans le traitement par lots distribués cercles. We had used it earlier in DoubleTwist for genomic annotations. Nous avions utilisé plus tôt dans DoubleTwist pour les annotations génomiques. Portable Batch System (or simply PBS) is a software job scheduler that allocates networked resources to batch jobs. Portable Batch System (PBS ou tout simplement) est un logiciel ordonnanceur qui alloue les ressources en réseau à des emplois lot. It can schedule jobs to execute on networked, multi-platform UNIX environments (and widnows if you are using PBSPro). Il peut calendrier emplois à exécuter en réseau, multi-plate-forme les environnements UNIX (widnows et si vous utilisez PBSPro). It is a superb envrionment to run discrete jobs in wide variety of languages (language independent) like Java or Perl (we used both). Il est un superbe envrionment à courir discret emplois dans plusieurs langues (la langue indépendante) comme Java ou Perl (nous avons utilisé les deux).
For a long time PBS was free and openly available. Pendant longtemps, PBS est gratuit et librement accessibles. However recently it is hidden behind compulsory regsitration which has to be manually reviewed (with promise of taking several days to approve). Mais récemment, il est caché derrière regsitration obligatoire qui doit être examinée manuellement (avec la promesse de prendre plusieurs jours pour approuver). In short lots of pain. En bref beaucoup de douleur. An alternative is to download PBSPro at a premium price. Une autre solution consiste à télécharger PBSPro à une prime de prix. However I have better alternatives for you. Mais j'ai de meilleures solutions pour vous.
You can easily download OpenPBS Vous pouvez facilement télécharger OpenPBS here ici . It contains the latest available version of OpenPBS. Il contient la dernière version disponible de OpenPBS. OpenPBS is not currently undergoing active development by the owner as its resource are focussed on PBSPro. OpenPBS n'est pas actuellement en cours de développement actif par le propriétaire que ses ressources sont axées sur PBSPro. You can Vous pouvez download PBS patches PBS télécharger les correctifs from Argonne National Laboratory. de Argonne National Laboratory.
A better alternative is to use Une meilleure solution est d'utiliser Torque Resource Manager Couple gestionnaire de ressources . It is a community effort based on the PBS project. Il s'agit d'un effort communautaire basé sur le projet CPE. However it has been significantly improved over the years with more than 1,200 patches, has incorporated significant advances in the areas of scalability, fault tolerance, and feature extensions contributed by NCSA, OSC, USC , the US Dept of Energy, Sandia, PNNL, U of Buffalo, TeraGrid, and many other leading edge HPC organizations. Toutefois, il a été sensiblement améliorée au fil des ans avec plus de 1200 patchs, a incorporé des avancées significatives dans les domaines de l'évolutivité, la tolérance de panne, et disposent d'extensions contribué par NCSA, de la CVMO, USC, les États-Unis Département de l'énergie, Sandia, PNNL, U de Buffalo, TeraGrid, et bien d'autres avant-garde HPC organisations.
TORQUE provides enhancements over standard OpenPBS in the following areas: COUPLE fournit des améliorations sur la norme OpenPBS dans les domaines suivants:
* Fault Tolerance * Tolérance aux pannes
o Additional failure conditions checked/handled o additionnelle de défaillance vérifié ou gérée
o Node health check script support o Noeud de santé script soutien
* Scheduling Interface * Programmation Interface
o Extended query interface providing the scheduler with additional and more accurate information o extension de requête Internet permettant l'ordonnanceur et d'autres informations plus précises
o Extended control interface allowing the scheduler increased control over job behavior and attributes o Extension de contrôle d'interface permettant l'ordonnanceur un meilleur contrôle sur le comportement d'emploi et les attributs
o Allows the collection of statistics for completed jobs o Permet la collecte de statistiques pour les travaux terminés
* Scalability * L'extensibilité
o Significantly improved server to MOM communication model o De manière significative à l'amélioration de serveur MOM modèle de communication
o Ability to handle larger clusters (over 15 TF/2,500 processors) o La capacité à traiter de plus grands groupes (plus de 15 processeurs TF/2500)
o Ability to handle larger jobs (over 2000 processors) o La capacité à traiter de plus grands emplois (plus de 2000 processeurs)
o Ability to support larger server messages o La capacité à soutenir plus grand serveur de messages
* Usability * Evaluation de l'utilisabilité
o Extensive logging additions o Des ajouts d'exploitation forestière
o More human readable logging (ie no more ‘error 15038 on command 42′) o Plus lisible par l'homme d'exploitation forestière (c'est-à-dire pas plus de message d'erreur 15038 sur commande 42 ')
My personal recommendation is that you should go ahead and adopt Torque if you foresee long involvement with distributed batch processing. Ma recommandation personnelle est que vous devriez aller de l'avant et d'adopter de couple, si vous prévoyez longue participation distribué avec le traitement par lots.
For short stints OpenPBS might suit you just fine. Pour les courtes stints OpenPBS pourrait vous convenir parfaitement. However for that you may also consider Toutefois, pour que vous aussi envisager de mai CHAOS as a simpler solution. comme une solution plus simple.
Note: CHAOS is a secure OpenMosix based Linux clustering solution which is fundamentally different from PBS and potentially faster. Note: le chaos est un sûr OpenMosix Linux basée sur le regroupement solution qui est fondamentalement différent de PBS et potentiellement plus rapide.
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